Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod3E9QA62 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod3E9QA62 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms