Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms