Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdzd7E9Q9W7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd7E9Q9W7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms