Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ankrd35E9Q9D8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd35E9Q9D8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ankrd35E9Q9D8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms