Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Col22a1E9Q7P1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms