Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Urb2E9Q7L1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Urb2E9Q7L1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Urb2E9Q7L1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Urb2E9Q7L1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms