Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
1700024B05RikE9Q6D7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
1700024B05RikE9Q6D7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700024B05RikE9Q6D7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms