Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D3

Ccdc121, Coiled-coil domain-containing 121, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc121E9Q6D3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc121E9Q6D3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc121E9Q6D3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc121E9Q6D3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc121E9Q6D3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc121E9Q6D3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc121E9Q6D3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc121E9Q6D3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc121E9Q6D3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc121E9Q6D3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc121E9Q6D3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc121E9Q6D3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc121E9Q6D3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc121E9Q6D3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc121E9Q6D3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc121E9Q6D3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc121E9Q6D3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms