Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcnt4E9Q649 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcnt4E9Q649 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms