Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn2r56E9Q4U5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn2r56E9Q4U5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn2r56E9Q4U5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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