Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd1E9Q3H4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms