Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup153E9Q3G8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup153E9Q3G8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup153E9Q3G8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup153E9Q3G8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup153E9Q3G8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup153E9Q3G8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup153E9Q3G8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup153E9Q3G8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup153E9Q3G8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup153E9Q3G8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nup153E9Q3G8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nup153E9Q3G8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms