Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrp3E9Q1T6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrp3E9Q1T6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrp3E9Q1T6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrp3E9Q1T6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrp3E9Q1T6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrp3E9Q1T6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrp3E9Q1T6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrp3E9Q1T6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrp3E9Q1T6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrp3E9Q1T6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrp3E9Q1T6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrp3E9Q1T6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrp3E9Q1T6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms