Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3250E9Q1M3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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