Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms