Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp54bE9PXC0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp54bE9PXC0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms