Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG6

Ncapg, Non-SMC condensin I complex, subunit G, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcapgE9PWG6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NcapgE9PWG6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NcapgE9PWG6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NcapgE9PWG6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NcapgE9PWG6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NcapgE9PWG6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NcapgE9PWG6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NcapgE9PWG6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NcapgE9PWG6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NcapgE9PWG6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NcapgE9PWG6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NcapgE9PWG6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NcapgE9PWG6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NcapgE9PWG6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NcapgE9PWG6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms