Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc175E9PVB3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc175E9PVB3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms