Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syde2E9PUP1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syde2E9PUP1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms