Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3bE9PUL3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms