Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms