Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd1D3YXK1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Samd1D3YXK1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms