Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3259D3YUK0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3259D3YUK0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3259D3YUK0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms