Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d4D3YUH6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2d4D3YUH6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms