Protein–RNA interactions for Protein: D2XZ31

Scgb1b29, ABPA7 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b29D2XZ31 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b29D2XZ31 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b29D2XZ31 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms