Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrc5C3VPR6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms