Protein–RNA interactions for Protein: B9EKX1

Ptchd4, Patched domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 904 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptchd4B9EKX1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptchd4B9EKX1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ptchd4B9EKX1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptchd4B9EKX1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptchd4B9EKX1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptchd4B9EKX1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptchd4B9EKX1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptchd4B9EKX1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptchd4B9EKX1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptchd4B9EKX1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptchd4B9EKX1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptchd4B9EKX1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptchd4B9EKX1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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