Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnldc1B2RXZ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnldc1B2RXZ1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnldc1B2RXZ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms