Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp26c1B2RXA7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26c1B2RXA7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms