Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms