Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hbb-bh2B2RVB7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hbb-bh2B2RVB7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hbb-bh2B2RVB7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hbb-bh2B2RVB7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms