Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rd3lB2RV38 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms