Protein–RNA interactions for Protein: B2RUK9

Zfp456, Zinc finger protein 456, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp456B2RUK9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp456B2RUK9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp456B2RUK9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp456B2RUK9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp456B2RUK9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp456B2RUK9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp456B2RUK9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms