Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt4B2RU40 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Prrt4B2RU40 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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