Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf518bB2RRE4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf518bB2RRE4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf518bB2RRE4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms