Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtpruB1AUH1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtpruB1AUH1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.56■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PtpruB1AUH1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtpruB1AUH1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms