Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spocd1B1ASB6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spocd1B1ASB6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms