Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Skint5A7XUY5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skint5A7XUY5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skint5A7XUY5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skint5A7XUY5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skint5A7XUY5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skint5A7XUY5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Skint5A7XUY5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Skint5A7XUY5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Skint5A7XUY5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Skint5A7XUY5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Skint5A7XUY5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Skint5A7XUY5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Skint5A7XUY5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Skint5A7XUY5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms