Protein–RNA interactions for Protein: A6H5Y3

Mtr, Methionine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrA6H5Y3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrA6H5Y3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MtrA6H5Y3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms