Protein–RNA interactions for Protein: A6BLY7

Krt28, Keratin, type I cytoskeletal 28, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt28A6BLY7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt28A6BLY7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt28A6BLY7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt28A6BLY7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms