Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F6

Ttll13, Tubulin polyglutamylase TTLL13, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll13A4Q9F6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttll13A4Q9F6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll13A4Q9F6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ttll13A4Q9F6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttll13A4Q9F6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttll13A4Q9F6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttll13A4Q9F6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttll13A4Q9F6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttll13A4Q9F6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttll13A4Q9F6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms