Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trmt1lA2RSY6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trmt1lA2RSY6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms