Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Xlr4aA2BI40 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xlr4aA2BI40 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms