Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Lcn6A2AJB9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Lcn6A2AJB9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Lcn6A2AJB9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lcn6A2AJB9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Lcn6A2AJB9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Lcn6A2AJB9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lcn6A2AJB9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms