Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel3A2AHA7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramel3A2AHA7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms