Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms