Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms