Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem185aA2AF53 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms