Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Pramef6A2A8M8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef6A2A8M8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms