Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd5A2A8L1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd5A2A8L1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms